Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms