Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms