Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDS5AQ29RF7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms