Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA9Q16790 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA9Q16790 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA9Q16790 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA9Q16790 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CA9Q16790 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CA9Q16790 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CA9Q16790 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CA9Q16790 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA9Q16790 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CA9Q16790 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms