Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA3Q16787 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms