Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN3Q16667 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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