Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDB1Q16531 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDB1Q16531 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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