Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA4Q16363 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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