Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP6AP1Q15904 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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