Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUL1Q15846 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLUL1Q15846 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLUL1Q15846 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUL1Q15846 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms