Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NFKBIBQ15653 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKBIBQ15653 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms