Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP4Q15650 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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