Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF1CQ15572 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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