Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDGFRLQ15198 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDGFRLQ15198 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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