Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CLCA4Q14CN2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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