Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms