Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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