Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL9A2Q14055 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL9A2Q14055 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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COL9A2Q14055 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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