Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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