Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBA3CQ13748 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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