Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALKBH1Q13686 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms