Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms