Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms