Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSAMPQ13449 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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