Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMS2P3Q13401 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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