Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B2Q13367 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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