Protein–RNA interactions for Protein: Q13201

MMRN1, Multimerin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMRN1Q13201 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MMRN1Q13201 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MMRN1Q13201 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms