Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAF1BQ13112 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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