Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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