Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFX1Q12986 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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