Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FOXC1Q12948 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FOXC1Q12948 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FOXC1Q12948 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FOXC1Q12948 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXC1Q12948 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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