Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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