Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP53BP1Q12888 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms