Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SREBF2Q12772 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SREBF2Q12772 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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