Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EP300Q09472 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EP300Q09472 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EP300Q09472 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
EP300Q09472 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EP300Q09472 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EP300Q09472 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EP300Q09472 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms