Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C2orf54Q08AI8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms