Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG1Q06432 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms