Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNEQ04844 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms