Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms