Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLCB3Q01970 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms