Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms