Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK6Q00534 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms