Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms