Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL20P78556 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL20P78556 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL20P78556 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms