Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL3P58872 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms