Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP4P57796 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CABP4P57796 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CABP4P57796 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CABP4P57796 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABP4P57796 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms