Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX17P56962 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STX17P56962 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX17P56962 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX17P56962 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX17P56962 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX17P56962 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms