Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX2P52951 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBX2P52951 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBX2P52951 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX2P52951 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms