Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK2P49760 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK2P49760 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLK2P49760 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK2P49760 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms