Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A9P48067 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC6A9P48067 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms